Os Departamentos dos Cursos são unidades orgânicas de base fundamental para o funcionamento da instituição, que se dedicam ao desenvolvimento de actividades de ensino e de investigação associadas à formação a nível de licenciaturas nas diferentes áreas do conhecimento.Os Departamentos dos Cursos são mono disciplinares, pluridisciplinares ou interdisciplinares de criação ou transmissão de conhecimentos, dotados de recursos humanos e materiais necessários ao seu cabal funcionamento, às quais competirá programar, executar e avaliar, de modo integral, os planos de estudo das distintas unidades curriculares. O ISPLB integra os seguintes Departamentos dos Cursos:
O Departamento de Assuntos Académicos (DAAC) é um órgão pertencente à Direcção Geral, enquanto órgão executivo, e depende deste metodológica e organicamente, sendo dirigido por um responsável pela gestão académica e pedagógica do ISPLB, que depende metodológica e organicamente do Presidente da Instituição e é dirigido por um Responsável pelos Serviços nomeado por despacho do Presidente, consultados o Administrador Delegado e a Administração. O DAAC é a interface entre as unidades orgânicas e o corpo docente e discente. A sua estrutura compreende o Responsável pelos Serviços (Vice-Presidente para a área académica) e o Chefe da Secretaria Pedagógica que depende hierárquica e funcionalmente do responsável do DAAC, o Gabinete de Termos e a Divisão de Professores.O Departamento dos Assuntos Académicos rege-se por normas próprias de acordo com os Estatutos e Regulamentos do ISPLB. O DAAC assegura o normal funcionamento do ISPLB nos aspectos técnico e administrativo.
O Departamento de Pós-graduações, Investigação Científica, Capacitação e Empreendedorismo é o órgão executivo responsável pela gestão científica, académica e pedagógica dos Cursos de Pós-graduação, do Núcleo de Investigação Científica, do Núcleo de Capacitação e Empreendedorismo e da Biblioteca, e que depende metodológica e organicamente do Presidente da Instituição e tem a seguinte estrutura:
Núcleo de Investigação Científica tem como característica o incentivo à criação de uma cultura de investigação científica no ISPLB, contando para isto, com a criação de projectos formais de investigação, realização de palestras, conferências e seminários que fomentem a criação de sinergias entre líderes e investigadores locais, nacionais e internacionais. O Núcleo de Capacitação e Empreendedorismo tem como foco a melhoria do desenvolvimento profissional dos docentes, discentes e colaboradores do ISPLB, assim como da comunidade. O Núcleo terá a capacidade de desenvolver as seguintes actividades:
O Provedor do Estudante é um órgão independente que tem como função a defesa e a promoção dos direitos e interesses dos estudantes no âmbito do ISPLB.Compete ao Provedor do Estudante apreciar queixas dos Estudantes sobre matérias pedagógicas e matérias administrativas com elas conexas, assim como sobre outros aspectos da sua vida académica, e dirigir aos órgãos competentes do ISPLB as recomendações que considere necessárias e adequadas à prevenção e reparação das injustiças verificadas. Ainda, deve o Provedor do Estudante dar respostas às diferentes necessidades do Estudante (ansiedades, fraca capacidade de organização do seu tempo, entre outras) durante o seu processo académico.